- Atuar em regiões representativas da Mata Atlântica, em especial na região do Mosaico de Áreas Protegidas do Lagamar, na Floresta Ombrófila Mista e nos Campos no Paraná.
- Produzir, integrar e divulgar o conhecimento científico, visando desenvolver modelos para o manejo racional dos recursos naturais e subsidiar políticas públicas de conservação;
- Identificar, consolidar e convergir iniciativas de levantamento da biodiversidade já existentes e que possam ser utilizadas para delinear uma base nacional de gestão do conhecimento sobre biodiversidade da Mata Atlântica, desenvolvendo ferramentas para compilação, análise e disponibilização do conhecimento gerado pela pesquisa científica;
- Padronizar os procedimentos com a utilização de protocolos específicos de pesquisa, de modo a permitir a comparação e a integração dos resultados obtidos, e também, contribuir com as políticas de gerenciamento de material biológico coletado, depositando-o em coleções biológicas consolidadas, assim como disponibilizar os dados não-sensíveis;
- Desenvolvimento de sistemas de classificação biológica para habitats da Mata Atlântica e de monitoramento da biodiversidade envolvendo também questões relativas a adaptação às mudanças climáticas;
- Dar suporte a ações de manejo das unidades de conservação regionais, públicas e privadas, a partir do fomento à pesquisa científica, às atividades educativas e da busca por contínuos avanços em estrutura e capital humano demandados nestas áreas protegidas;
- Implementar pesquisas que subsidiem a implementação de ações de manejo em unidades de conservação e seu entorno tais como, nos programas de proteção, na restauração ambiental e no desenvolvimento de alternativas de renda para as comunidades locais;
- Desenvolver pesquisas visando à caracterização e valoração dos serviços ecossistêmicos, monitoramento de impactos e adaptação às mudanças climáticas;
- Desenvolver programas de educação ambiental e formação de recursos humanos, através de cursos de capacitação para estudantes, empresas, ongs e poder público, subsidiados pelas pesquisas científicas;
- Participar de diferentes fóruns de discussão contribuindo com a disseminação do conhecimento e formulação de políticas públicas;
- Divulgar o resultado dos projetos através de diferentes ferramentas de comunicação.
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